污水排放总量增长速度较快，主要污染物排放量居高不下。2006年，我国污水排放总量536.8亿吨，比上年增长2.3%。其中，工业废水排放量240.2亿吨，比上年减少1.2%。工业废水排放量占废水排放总量的44.7%，比上年略有降低。生活污水排放量296.6亿吨，比上年增加5.4%。生活污水排放量占废水排放总量的55.3%，比上年略有上升。2007年全国污水排放总量580亿吨，同比增长5.88%。
2008年全国地表水污染依然较重。长江、黄河、珠江、松花江、淮河、海河和辽河等七大水系总体为轻度污染。204条河流409个国控断面中，Ⅰ至Ⅲ类、Ⅳ至Ⅴ类和劣Ⅴ类水质的断面比例分别为59.9%、23.7%和16.4%。长江、珠江总体水质良好，松花江、淮河为轻度污染，黄河、辽河为中度污染，海河为重度污染。湖泊(水库)富营养化问题依然突出，在监测营养状态的26个湖泊(水库)中，富营养化状态的占42.3%。
全国近岸海域水质总体为轻度污染。一、二类海水比例为62.7%，三类海水为14.1%，四类和劣四类海水为23.2%。四大海区中，黄海和南海近岸海域水质良好，渤海近岸海域水质差，东海近岸海域水质极差。