水环境和水中的微生物
自然界的水，包括淡水和海水，其来源是陆地水和雨雪。
陆地水分为地表水和地下水，地表水分为江、河、湖泊的水，地下水是地表以下岩洞孔隙、裂隙或溶洞中的水。除了埋藏较深的地下水外，其他各类自然界的水域中均有微生物存在。
水中微生物种类很多，但不同水域种类和数量上差异很大。
自然界的水域中，一般营养物较缺乏，多数微生物常在饥饿的状态下生活，因此在水中存活的许多微生物可以在稀薄的营养环境下生活。
水中异养菌的种类和数量均较多，水中也有自养菌。