利用微生物处理废水的方法叫做生物处理法，废水中的混合微生物群体对废水中的各种有机污染物进行吸收、转化，同时通过扩散、吸附、凝聚、氧化分解、沉淀等作用，去除水中的污染物。
废水生物处理实际上是水体自净的强化。人为创造微生物生长的适宜条件，使微生物高浓度的富集在特定的构筑物中，通过微生物将有机物最终转化为简单无机物。