本设计要求处理肇庆某生物工程基地3000吨/日的氨基酸发酵废水。进水水质为BOD5：2000mg/L，CODcr：3000mg/L， SS：800mg/L， 氨氮：30mg/L，磷酸盐：10mg/L。出水水质达到《广东省地方标准—水污染物排放限值》（DB44/26-2001）二时段一级标准的要求。具体出水指标为：BOD5≤20mg/L， CODcr≤60mg/L，SS：60mg/L，TN≤10mg/L，TP≤0.5mg/L。
通针对氨基酸发酵废水高COD、高BOD、以及具有酸性、氨氮含量高等特点，在参照了国内外运用各种工艺处理氨基酸发酵废水成功经验的基础上，本设计采取了最经典而更先进有效的厌氧—好氧工艺：UASB+CASS组合工艺。该工艺具有污水处理效率高，运行能耗低，生物脱氮除磷效果好、除COD、BOD效率高的优点。基本工艺流程为：隔栅→调节池→集水池→UASB反应池→配水井→CASS反应池→出水。
本设计的主要出水指标经过处理后全部达到排放标准的要求并排放。工程总投资为469.7万元，每年的总运行费用为187.52万元，每吨水的运行费用是1.71元/天。