城市污水经5#泵站输送至厂内细格栅和360度旋流沉砂池进行预处理，用于除去水中的悬浮物、飘浮物和砂粒，以保证后续处理构筑物的正常运行。
污水经预处理后进入生物反应池，该池由厌氧、缺氧和好氧三个区组成。出水端设有回流泵房、剩余污泥泵房，污泥回流比为50~100%，混合液回流比为50%~150%，均回流到缺氧区。
剩余污泥由泵送至浓缩池，然后进入脱水机房进行离心脱水，泥饼用泵输送至码头外运,经处理后填埋。
污水经生物反应池处理后进入二沉池配水井，由配水井配水至周进周出的二沉池进行固液分离，二沉池出水进入加氯接触池，消毒后排入珠江，污泥回流至污泥泵房。其出水符合国家和广东省污水排放的一级出水标准。
