A岛地势由东南向西北倾斜，呈中低山、丘陵、台地、平原、滩涂依次梯状分布，构成向东南开口的马蹄形地形。地势由南向北倾斜，西北部较平坦，南部则多山，最高为海拔约340m的云顶岩。云顶岩山麓，发育为东北向、西北向为主的断裂带。本区岩体主要为花岗岩，受构造及风化作用的影响，岩体中节理、裂隙以NW270～310度走向较发育，其次为NE80～90度，倾角以80～90度为主，其次为60～80度，线路走向与节理裂隙斜交。